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La genética molecular · Del ADN a la proteína

La expresión génica

Una tortilla de maíz azul tiene el color que tiene porque las células del grano fabrican pigmentos gracias a proteínas específicas. Pero el ADN de esas células nunca sale del núcleo, y las proteínas se arman en el citoplasma. ¿Cómo viaja la información de un gen hasta el lugar donde se fabrica la proteína? Ese uso del gen se llama expresión génica y ocurre en dos etapas, transcripción y traducción, que forman el llamado dogma central de la biología molecular: ADN → ARN → proteína.

La transcripción: del gen al ARN mensajero

En las células eucariotas el ADN permanece dentro del núcleo, pero las proteínas se fabrican en el citoplasma. La solución de la célula es hacer una copia portátil del gen: el ARN mensajero.

Transcripción en una célula eucariota: dentro del núcleo, la ARN polimerasa abre la doble hélice de ADN, recorre la cadena molde en sentido 3'→5' y sintetiza un ARNm complementario en sentido 5'→3'; el ARNm terminado sale por un poro nuclear al citoplasma, donde se une a un ribosoma. núcleo citoplasma 3' 5' 5' 3' cadena codificante ADN: cadena molde (leída 3'→5') promotor ARN polimerasa avanza ARNm: copia (5'→3') 5' 3' ARNm terminado sale al citoplasma ARNm 5' ribosoma poro nuclear membrana nuclear
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Define transcripción y traducción e indica en qué lugar de la célula eucariota tiene lugar cada uno de estos procesos.

Define transcripción y traducción e indica en qué lugar de la célula eucariota tiene lugar cada uno de estos procesos.

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A partir de la hebra molde de ADN 3'-TACGGAACT-5', obtén la secuencia del ARNm mensajero resultante indicando su polaridad, y señala cuántos aminoácidos como máximo…

A partir de la hebra molde de ADN 3'-TACGGAACT-5', obtén la secuencia del ARNm mensajero resultante indicando su polaridad, y señala cuántos aminoácidos como máximo puede codificar ese fragmento.

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El código genético

Esquema del código genético: el codón AUG del ARNm, formado por las bases A, U y G, codifica el aminoácido metionina e indica el inicio; hay 64 codones para 20 aminoácidos, por lo que el código es degenerado. A U G codón AUG (inicio) metionina 64 codones 20 aminoácidos → código degenerado
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¿Qué es un codón? Indica cuántos nucleótidos lo forman, cuántos codones distintos existen y cuántos aminoácidos diferentes codifican en conjunto.

¿Qué es un codón? Indica cuántos nucleótidos lo forman, cuántos codones distintos existen y cuántos aminoácidos diferentes codifican en conjunto.

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Observa el esquema del flujo de la información genética. Indica qué moléculas se señalan con A, B y C, qué procesos ocurren en las flechas 1 y 2, y qué representa la…

Observa el esquema del flujo de la información genética. Indica qué moléculas se señalan con A, B y C, qué procesos ocurren en las flechas 1 y 2, y qué representa la zona rodeada con línea discontinua.

A 1 B 2 C
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Considera el siguiente fragmento de la secuencia codificante de un ARNm que se traduce en una proteína citoplasmática: $5'\text{--- AUG - UCU - UCC - UCA - UCG --- } 3'$…

Considera el siguiente fragmento de la secuencia codificante de un ARNm que se traduce en una proteína citoplasmática:

$5'\text{--- AUG - UCU - UCC - UCA - UCG --- } 3'$

(Nota: los cuatro codones que siguen al codón de inicio AUG codifican todos el aminoácido serina).

  1. a) A partir de este caso concreto, justifica por qué el código genético es degenerado y demuestra que esta propiedad no equivale a decir que el código sea «ambiguo».
  2. b) Supón que se introducen dos mutaciones puntuales independientes: el Mutante 1 cambia el segundo codón de UCU a UCC; el Mutante 2 cambia el tercer codón de UCC a UAC (que codifica tirosina). Compara el impacto de ambas mutaciones en la secuencia de aminoácidos de la proteína y clasifica cada mutación según su efecto funcional.
  3. c) Razona qué ventaja adaptativa confiere el hecho de que la degeneración del código genético se concentre casi siempre en la tercera base de cada triplete (hipótesis del balanceo) en lugar de en la primera o la segunda frente a las mutaciones puntuales espontáneas.
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La traducción: del ARNm a la proteína

El ARNm usa solo 4 nucleótidos (A, U, G, C), pero las proteínas tienen 20 aminoácidos distintos. ¿Cómo convierte la célula un texto de cuatro letras en una cadena de aminoácidos?

Animación de la traducción: un ARNt trae un aminoácido desde la derecha hasta el codón del ARNm, el aminoácido se une a la cadena, el ARNt sale, el ARNm avanza un codón y el polipéptido crece. cadena de aminoácidos = proteína ribosoma ARNm leído codón a codón

Los tres tipos de ARN trabajan juntos: el ARNm lleva el mensaje (la secuencia de codones), el ARNt lleva cada aminoácido y lo coloca según su anticodón, y el ARNr es el componente estructural y catalítico del ribosoma.

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A partir de la siguiente tabla del código genético: | Codón | Aminoácido | | :---: | :---: | | AUG | Metionina (Met) | | CCU | Prolina (Pro) | | GCU | Alanina (Ala) | |…

A partir de la siguiente tabla del código genético:

Codón Aminoácido
AUG Metionina (Met)
CCU Prolina (Pro)
GCU Alanina (Ala)
UAA Parada (Fin)
UAU Tirosina (Tyr)
  1. a) Traduce el siguiente $\text{ARNm}$: $5'\text{-AUGGCUUAA-}3'$, e indica la secuencia de aminoácidos resultante.
  2. b) Explica qué papel desempeñan el primer y el último codón del fragmento.
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Diferencia la función del ARNm, del ARNt y del ARNr en la síntesis de proteínas, indicando qué aporta cada tipo de ARN al proceso.

Diferencia la función del ARNm, del ARNt y del ARNr en la síntesis de proteínas, indicando qué aporta cada tipo de ARN al proceso.

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Seguir un ARNt por el ribosoma

El ribosoma tiene tres sitios. Un ARNt cargado aporta su aminoácido al sitio A; el sitio P mantiene el ARNt unido al péptido en crecimiento; el sitio E deja salir el ARNt descargado. El ARNt iniciador es la excepción: entra directamente en P. El ribosoma avanza sobre el ARNm de 5' a 3'.

Ribosoma leyendo el ARNm de 5′ a 3′, con un ARNt en cada sitio: aminoacil-ARNt entrando en A, peptidil-ARNt con el péptido en crecimiento en P y ARNt descargado saliendo por E. avance del ribosoma (lectura 5′ → 3′) entra aminoacil-ARNt sale el ARNt descargado péptido en crecimiento C 5′ 3′ ARNm N E P A
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El siguiente esquema representa un ribosoma funcional durante la fase de elongación de la traducción: a) Deduce justificadamente la polaridad (extremos $5'$ y $3'$) de…

El siguiente esquema representa un ribosoma funcional durante la fase de elongación de la traducción:

ARNm AUG GCU UAA UAC ? codón de stop
  1. a) Deduce justificadamente la polaridad (extremos $5'$ y $3'$) de la cadena de ARNm y el sentido en el que se desplazará el ribosoma a lo largo de ella.
  2. b) Escribe la secuencia del anticodón del ARNt interrogado (?) especificando obligatoriamente su polaridad $5'\to 3'$ y razona qué aminoácido transporta sabiendo que el codón GCU codifica alanina.
  3. c) En una cepa mutante se produce un ARNt supresor capaz de reconocer el codón UAA introduciendo el aminoácido tirosina. Predice qué ocurrirá con la traducción y con la longitud de la proteína resultante cuando el ribosoma alcance la posición señalada con el codón de stop respecto a la célula silvestre.
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El procesamiento del ARNm en eucariotas

Si se compara el ARN recién transcrito en el núcleo con el ARNm que llega al ribosoma, este último es a menudo mucho más corto. ¿Adónde van los fragmentos que faltan?

Esquema del splicing en eucariotas: el ARNm primario, con tres exones e intrones intercalados, pierde los intrones y deja un ARNm maduro formado solo por los exones unidos. Exón 1 Intrón 1 Exón 2 Intrón 2 Exón 3 ARNm primario: exones (color) + intrones (gris) splicing Exón 1 Exón 2 Exón 3 ARNm maduro: solo exones unidos
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En el genoma humano, el gen de la fibronectina contiene numerosos exones e intrones. En los fibroblastos da lugar a una isoforma proteica insoluble que forma parte de la…

En el genoma humano, el gen de la fibronectina contiene numerosos exones e intrones. En los fibroblastos da lugar a una isoforma proteica insoluble que forma parte de la matriz extracelular, mientras que en los hepatocitos origina una isoforma soluble que circula en el plasma sanguíneo.

  1. a) Justifica mediante qué mecanismo molecular una única secuencia de ADN genómico puede dar lugar a estas dos proteínas con funciones y localizaciones tan distintas.
  2. b) Un paciente presenta una mutación puntual consistente en una transición (G por A) en el sitio aceptor de corte y empalme (splicing) del intrón 4 de este gen. Predice dos posibles alteraciones en la estructura del ARNm maduro resultante y sus consecuencias sobre la proteína sintetizada.
  3. c) Si clonamos este gen humano intacto (con todos sus intrones y exones) en un plásmido y lo introducimos en Escherichia coli, razona si la bacteria sintetizará la fibronectina humana funcional.
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Expresión génica en bacterias y en eucariotas

Comparación de la expresión génica: en la bacteria, sin núcleo, los ribosomas traducen el ARNm mientras la ARN polimerasa aún lo transcribe; en la célula eucariota, el pre-ARNm se transcribe y se madura por corte y empalme en el núcleo, sale por un poro nuclear y se traduce después en el citoplasma. Bacteria: sin núcleo ADN ARN polimerasa avance ribosomas ARNm 5' polipéptido citoplasma Acopladas: los ribosomas traducen el ARNm mientras la ARN polimerasa aún lo transcribe. Eucariota: con núcleo núcleo pre-ARNm intrones corte y empalme ARNm maduro envoltura nuclear poro nuclear citoplasma ribosomas 5' 3' polipéptidos Separadas: transcripción y maduración en el núcleo; la traducción ocurre después, en el citoplasma.

Vuelve al principio: el ADN no sale del núcleo, pero su mensaje sí. La ARN polimerasa copia el gen en un ARNm, que se procesa, sale por los poros nucleares y en el citoplasma los ribosomas lo traducen codón a codón. Así las células del maíz azul fabrican sus pigmentos.

Resumen

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