Eubacterias y arqueobacterias
En una sola cucharada de tierra de chacra viven más bacterias que personas hay en todo el Perú. Son los organismos más antiguos, más numerosos y metabólicamente más versátiles de la Tierra: hay bacterias que respiran azufre, que fabrican oxígeno, que viven a 110 °C o que sobreviven en salmueras saturadas. Hasta en las salinas de Maras, en Cusco, a más de 3,000 m s. n. m., hay microbios adaptados a vivir entre sal. Para entender la vida microbiana hay que empezar por su célula.
La célula procariota
Al microscopio, una célula de la mejilla teñida muestra un núcleo oscuro bien delimitado, mientras que las bacterias del yogur se ven homogéneas, sin ninguna compartimentación interna visible. ¿Dónde guardan su material genético si no tienen núcleo?
Indica tres diferencias estructurales entre una célula procariota bacteriana y una célula eucariota, y explica qué consecuencia funcional tiene cada una.
Indica tres diferencias estructurales entre una célula procariota bacteriana y una célula eucariota, y explica qué consecuencia funcional tiene cada una.
Formas y agrupaciones bacterianas
Ejemplos conocidos: Streptococcus pyogenes (cocos en cadena, causa de la faringitis), Escherichia coli (bacilo), Vibrio cholerae (vibrio, el del cólera) y Spirillum (espirilo).
Observa las bacterias del esquema (A a F). Clasifícalas según su forma (coco, bacilo, espirilo o vibrio) y, en su caso, según su agrupación (diplococos, estreptococos,…
Observa las bacterias del esquema (A a F). Clasifícalas según su forma (coco, bacilo, espirilo o vibrio) y, en su caso, según su agrupación (diplococos, estreptococos, estafilococos), poniendo un ejemplo conocido donde puedas.
Pared, cápsula, flagelos y pili
Si sumerges un glóbulo rojo en agua destilada, se hincha hasta estallar por ósmosis. Una bacteria de agua dulce no revienta: ¿qué estructura soporta esa enorme presión osmótica interna?
Explica qué es la pared celular bacteriana (peptidoglucano) y en qué consiste la tinción de Gram: qué dos grandes grupos distingue (grampositivas y gramnegativas) y por…
Explica qué es la pared celular bacteriana (peptidoglucano) y en qué consiste la tinción de Gram: qué dos grandes grupos distingue (grampositivas y gramnegativas) y por qué es tan útil para elegir un tratamiento.
a) Nombra tres estructuras externas que puede presentar una bacteria. b) Explica la función principal de cada una de ellas.
- a) Nombra tres estructuras externas que puede presentar una bacteria.
- b) Explica la función principal de cada una de ellas.
¿Qué es una endospora? Explica cómo se forma, qué resistencia extraordinaria tiene (calor, desecación, desinfectantes) y por qué complica la esterilización en medicina y…
¿Qué es una endospora? Explica cómo se forma, qué resistencia extraordinaria tiene (calor, desecación, desinfectantes) y por qué complica la esterilización en medicina y en conservas (ejemplos: tétanos, botulismo).
Metabolismo bacteriano y papel ecológico
Un plato de arroz, un rayo de sol o una roca con azufre pueden ser "alimento" para distintas bacterias. Todo depende de dónde obtengan la energía y el carbono.
Diferencia una bacteria aeróbica estricta, una anaeróbica estricta y una anaeróbica facultativa, y asocia cada tipo a un ambiente (superficie del suelo, fondo de una…
Diferencia una bacteria aeróbica estricta, una anaeróbica estricta y una anaeróbica facultativa, y asocia cada tipo a un ambiente (superficie del suelo, fondo de una herida profunda, tubo digestivo).
El metabolismo bacteriano es muy diverso. Describe los tipos fotoautótrofo, quimioautótrofo y heterótrofo: de dónde obtiene cada uno la energía y el carbono, y pon un…
El metabolismo bacteriano es muy diverso. Describe los tipos fotoautótrofo, quimioautótrofo y heterótrofo: de dónde obtiene cada uno la energía y el carbono, y pon un ejemplo de bacteria o de ambiente para cada tipo.
Explica el papel esencial de las bacterias en los ciclos del nitrógeno y del carbono (fijación, nitrificación, desnitrificación y descomposición) y razona qué ocurriría…
Explica el papel esencial de las bacterias en los ciclos del nitrógeno y del carbono (fijación, nitrificación, desnitrificación y descomposición) y razona qué ocurriría en los ecosistemas si desaparecieran.
Importancia de las bacterias
Un yogur, una infección y un derrame de petróleo tienen algo en común: bacterias. ¿Cómo pueden ser a la vez aliadas, enemigas y herramientas?
Las arqueobacterias metanógenas producen metano. Explica dónde viven (rumen de los herbívoros, fondos de pantanos y arrozales, plantas de tratamiento de aguas…
Las arqueobacterias metanógenas producen metano. Explica dónde viven (rumen de los herbívoros, fondos de pantanos y arrozales, plantas de tratamiento de aguas residuales), de qué se alimentan y por qué su metabolismo interesa a la vez al clima (el metano como gas de efecto invernadero) y a la energía (biogás).
La simbiosis bacteriana va mucho más allá del intestino humano. Describe un ejemplo concreto —las bacterias luminosas del calamar (Vibrio fischeri) o los nódulos de…
La simbiosis bacteriana va mucho más allá del intestino humano. Describe un ejemplo concreto —las bacterias luminosas del calamar (Vibrio fischeri) o los nódulos de Rhizobium en las leguminosas— explicando qué aporta cada socio y cómo se «reconocen» para establecer la asociación.
Cianobacterias, heterocistos y eutrofización
En verano, algunas lagunas y embalses del Perú se ponen verdes y huelen mal. ¿Qué organismo es el responsable y por qué aparece justo entonces?
Las cianobacterias hacen fotosíntesis oxigénica, como las plantas, pero son procariotas. Durante siglos se las llamó «algas azules», nombre incorrecto porque carecen de núcleo y de organelas; hace unos 2,400 millones de años su oxígeno transformó la atmósfera. Algunas, además, fijan nitrógeno con la enzima nitrogenasa. Hay un problema bioquímico: la nitrogenasa se inactiva con oxígeno, y la fotosíntesis produce oxígeno.
Las cianobacterias fueron llamadas «algas azules» durante siglos. Explica por qué ese nombre era incorrecto (organización procariota), qué fotosíntesis realizan…
Las cianobacterias fueron llamadas «algas azules» durante siglos. Explica por qué ese nombre era incorrecto (organización procariota), qué fotosíntesis realizan (oxigénica) y qué papel histórico jugaron en la atmósfera terrestre.
Durante un verano cálido, un embalse recibe un vertido rico en fósforo que desploma la relación nitrógeno:fósforo (N:P) del agua. Pocas semanas después se forma una…
Durante un verano cálido, un embalse recibe un vertido rico en fósforo que desploma la relación nitrógeno:fósforo (N:P) del agua. Pocas semanas después se forma una densa capa verdosa en la superficie dominada por cianobacterias filamentosas con heterocistes, y los análisis detectan niveles peligrosos de microcistinas.
- a) Justifica por qué las cianobacterias fijadoras de nitrógeno desplazan a las microalgas eucariotas cuando la relación N:P disminuye drásticamente. Explica qué incompatibilidad bioquímica fundamental resuelve el heterociste y qué adaptaciones estructurales y metabólicas presenta para lograrlo.
- b) Paradójicamente, a pesar de que las cianobacterias realizan la fotosíntesis oxigénica, los técnicos del embalse registran una mortandad masiva de peces por anoxia en las capas intermedias y de fondo. Deduce las causas ecológicas y bioquímicas de este colapso de oxígeno a lo largo de la columna de agua.
Respiraciones alternativas y sedimentos
Si cavas en el lodo de un lago o de un humedal como los Pantanos de Villa, en Lima, la capa superficial es clara y las de abajo son oscuras y huelen a huevo podrido. Los microbios cambian con la profundidad: ¿qué decide quién vive dónde?
Toda respiración pasa electrones de un donador (materia orgánica, NADH) a un aceptor final. Cuanto más positivo es el potencial redox $E'$ del aceptor, más energía se libera por electrón y más ATP puede fabricar la célula.
| Aceptor final | Producto | $E'$ aproximado (V) | Quién lo usa |
|---|---|---|---|
| $\mathrm{O_2}$ | $\mathrm{H_2O}$ | $+0.82$ | aerobios |
| $\mathrm{NO_3^-}$ | $\mathrm{N_2}$ | $+0.75$ | desnitrificantes |
| $\mathrm{SO_4^{2-}}$ | $\mathrm{H_2S}$ | $-0.22$ | sulfatorreductoras |
| $\mathrm{CO_2}$ | $\mathrm{CH_4}$ | $-0.24$ | arqueas metanogénicas |
En una mina de sulfuros metálicos se analizan dos zonas: una escombrera de pirita (FeS_2) compactada y sellada frente al aire, y otra escombrera idéntica pero porosa,…
En una mina de sulfuros metálicos se analizan dos zonas: una escombrera de pirita (FeS_2) compactada y sellada frente al aire, y otra escombrera idéntica pero porosa, húmeda y expuesta a la intemperie. El agua que drena de esta segunda escombrera tiene un pH de 1.7 y alta concentración de iones férricos (Fe^3+) y sulfato, debido a la acción de Acidithiobacillus ferrooxidans.
- a) Deduce el papel que desempeña A. ferrooxidans como catalizador biogeoquímico: explica qué especie química oxida, cuál es el aceptor final de electrones y por qué su metabolismo acidifica el medio de forma tan acusada. Clasifica su tipo metabólico según su fuente de carbono y energía.
- b) Una empresa minera utiliza biorreactores con A. ferrooxidans para lixiviar calcopirita de baja ley (biolixiviación), mientras que la Confederación Hidrográfica denuncia a la mina por el drenaje ácido de la escombrera abierta. Justifica químicamente por qué el mismo proceso microbiano constituye una biotecnología limpia y rentable en un contexto, pero una catástrofe ecotoxicológica para los ecosistemas fluviales en el otro.
Para reducir las emisiones de gases de efecto invernadero del ganado, se suministra a un lote de vacas un aditivo que bloquea la enzima metil-coenzima M reductasa de las…
Para reducir las emisiones de gases de efecto invernadero del ganado, se suministra a un lote de vacas un aditivo que bloquea la enzima metil-coenzima M reductasa de las arqueas metanogénicas del rumen. Durante los primeros días, las emisiones de CH_4 caen un 80 %, pero se observa una acumulación anormal de gas H2 libre en el rumen y una disminución en la digestión de la fibra de forraje (celulosa).
- a) Explica la relación de sintrofía que une a las bacterias celulolíticas y a las arqueas metanogénicas en condiciones normales, y razona por qué la acumulación de H2 libre frena termodinámicamente la degradación microbiana de la celulosa (inhibición por producto en la regeneración de NAD^+).
- b) Los veterinarios corrigen este problema aumentando la proporción de almidón en la dieta, lo que estimula a las bacterias que producen propionato frente a las que producen acetato. Justifica bioquímicamente por qué la síntesis de propionato actúa como un «sumidero alternativo de electrones» que desatasca la fermentación ruminal sin producir metano.
Microbiota, nicho y antibióticos
En el intestino de una persona sana viven billones de bacterias, y casi todas son inofensivas o útiles. ¿Por qué una bacteria que estaba ahí sin causar nada puede, de repente, enfermar al paciente?
Un paciente hospitalizado que recibe clindamicina (un antibiótico de amplio espectro) durante tres semanas desarrolla una diarrea grave por infección de Clostridioides…
Un paciente hospitalizado que recibe clindamicina (un antibiótico de amplio espectro) durante tres semanas desarrolla una diarrea grave por infección de Clostridioides difficile. Esta bacteria estaba presente en su intestino antes de iniciar el tratamiento, pero representaba menos del 0.1 % de la comunidad microbiana y no causaba ningún síntoma. Tras fracasar varias líneas de fármacos, se le practica un trasplante de microbiota fecal (TMF) de un donante sano, logrando erradicar la infección en 48 horas.
- a) Justifica este cuadro clínico empleando con precisión los conceptos ecológicos de nicho ecológico, exclusión competitiva y resistencia a la colonización.
- b) Diseña un experimento sencillo con ratones de laboratorio axénicos (libres de gérmenes) que permita discernir si el factor curativo del trasplante fecal radica en la competencia física directa ejercida por bacterias viables o en metabolitos protectores termoestables disueltos en el filtrado de las heces del donante.
Dos dominios: eubacterias y arqueobacterias
A finales de la década de 1970, Carl Woese comparó secuencias de ARN ribosómico y descubrió que los microbios de fuentes hidrotermales diferían más de Escherichia coli que esta de un vegetal. ¿Cómo pueden ser linajes tan distintos dos organismos de aspecto idéntico al microscopio?
Muchas arqueobacterias son extremófilas (termófilas, halófilas, acidófilas). Describe qué ambientes colonizan, qué adaptaciones bioquímicas les permiten vivir allí y por…
Muchas arqueobacterias son extremófilas (termófilas, halófilas, acidófilas). Describe qué ambientes colonizan, qué adaptaciones bioquímicas les permiten vivir allí y por qué su estudio interesa a las hipótesis sobre el origen de la vida.
Cita dos diferencias moleculares entre eubacterias y arqueobacterias (por ejemplo, en la pared celular o en los lípidos de membrana) y explica por qué se clasifican en…
Cita dos diferencias moleculares entre eubacterias y arqueobacterias (por ejemplo, en la pared celular o en los lípidos de membrana) y explica por qué se clasifican en dominios distintos.
Biofilms y medios de cultivo
Si pasas una noche sin cepillarte, sientes una capa pegajosa sobre los dientes. No son bacterias sueltas, sino una comunidad organizada. ¿Por qué cuesta tanto eliminarla con un antibiótico o un desinfectante?
En el laboratorio, para identificar una bacteria desconocida se usan medios de cultivo especiales.
Los biofilms son comunidades bacterianas adheridas a una superficie y envueltas en una matriz. Explica dónde se forman (sarro dental, catéteres, tuberías, piedras del…
Los biofilms son comunidades bacterianas adheridas a una superficie y envueltas en una matriz. Explica dónde se forman (sarro dental, catéteres, tuberías, piedras del río), por qué son mucho más resistentes a los antibióticos y a los desinfectantes que las bacterias libres y qué problemas causan en hospitales.
En el laboratorio se usan medios selectivos y diferenciales. Explica qué es cada tipo con un ejemplo (agar MacConkey selecciona gramnegativas y distingue fermentadoras…
En el laboratorio se usan medios selectivos y diferenciales. Explica qué es cada tipo con un ejemplo (agar MacConkey selecciona gramnegativas y distingue fermentadoras de lactosa; agar sangre revela la hemólisis) y qué información aportan al identificar una bacteria desconocida.
Transferencia horizontal de genes
Las bacterias se reproducen habitualmente por fisión binaria (cada célula se divide en dos idénticas), pero pueden adquirir ADN sin reproducirse. La transformación capta ADN libre del medio; la transducción lo transporta mediante bacteriófagos (virus de bacterias); la conjugación transfiere ADN, con frecuencia plásmidos, por contacto entre células.
¿Qué son los plásmidos? Explica qué tipo de genes suelen llevar (resistencias a antibióticos, toxinas) y por qué su capacidad de pasar de una bacteria a otra preocupa a…
¿Qué son los plásmidos? Explica qué tipo de genes suelen llevar (resistencias a antibióticos, toxinas) y por qué su capacidad de pasar de una bacteria a otra preocupa a los médicos.
Vuelve al principio: las bacterias son procariotas, sin núcleo ni organelas membranosas, y aun así dominan la Tierra por su metabolismo, su rapidez y su capacidad de intercambiar genes. Su ADN flota en el nucleoide y funcionan en suelo, agua, intestino y hasta en lugares extremos como las salinas de Maras.