L'observation de la cellule
Au laboratoire du lycée, tu déposes une goutte d'eau de mare sous le microscope : des paramécies filent dans tous les sens, mais leur membrane et leurs organites restent invisibles. Pourquoi ? Qu'est-ce qui limite ce que l'on peut voir d'une cellule, et comment fait-on pour aller plus loin ?
Microscopie optique et microscopie électronique
Il existe deux grandes familles de microscopes. Elles n'« éclairent » pas l'échantillon de la même façon, et c'est ce qui change tout.
Il existe deux types de microscopes électroniques. Le MET (à transmission) donne des images de l'intérieur des cellules (organites, membranes). Le MEB (à balayage) donne des images de la surface, en relief.
Les images en microscopie électronique sont en noir et blanc ; celles que tu vois dans les manuels sont souvent colorisées après coup pour mieux repérer les structures. Les couleurs ne sont pas celles de la réalité.
Un exemple d'application : les bactériophages sont des virus qui infectent les bactéries. Trop petits (environ 100 nm) pour être résolus au MO, ils ne se voient qu'au MET. Sur une image de MET, une bactérie infectée montre de petites particules (tête et queue) accrochées à sa paroi ou des particules virales à l'intérieur de la cellule.
Distinguer la microscopie optique de la microscopie électronique : ce que chacune utilise pour « éclairer » l'échantillon, quel type de structures chaque technique…
Distinguer la microscopie optique de la microscopie électronique : ce que chacune utilise pour « éclairer » l'échantillon, quel type de structures chaque technique permet d'observer et s'il est possible d'observer des cellules vivantes avec elles.
Une équipe de recherche veut vérifier si les bactéries d'un échantillon sont infectées par des bactériophages. Concevoir l'étude : choisir la technique de microscopie…
Une équipe de recherche veut vérifier si les bactéries d'un échantillon sont infectées par des bactériophages. Concevoir l'étude : choisir la technique de microscopie appropriée, justifier ce choix par rapport aux alternatives et décrire ce que l'équipe s'attendrait à observer si l'infection avait lieu.
Le microscope optique et le grossissement
En classe, tu observes des cellules d'oignon en changeant d'objectif : l'image devient plus grande à chaque fois. Comment le microscope combine-t-il ses lentilles pour obtenir le grossissement final ?
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La source de lumière éclaire la préparation.
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La platine supporte la lame.
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Le revolver porte plusieurs objectifs (×4, ×10, ×40, ×100).
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L'oculaire (souvent ×10) est la lentille devant laquelle on place l'œil.
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La vis macrométrique fait la mise au point rapide, la vis micrométrique la mise au point fine.
Nommer les parties de base d'un microscope optique (oculaire, objectifs, platine, vis macrométrique et micrométrique, source de lumière) et indiquer la fonction de…
Nommer les parties de base d'un microscope optique (oculaire, objectifs, platine, vis macrométrique et micrométrique, source de lumière) et indiquer la fonction de chacune.
Expliquer la différence entre grossissement et pouvoir de résolution d'un microscope et justifier pourquoi agrandir fortement une image sans améliorer la résolution (le…
Expliquer la différence entre grossissement et pouvoir de résolution d'un microscope et justifier pourquoi agrandir fortement une image sans améliorer la résolution (le « grossissement vide ») ne permet pas de distinguer plus de détails.
Taille réelle, barre d'échelle et ordres de grandeur
Sur une photographie de microscope, comment retrouver la taille réelle d'une cellule ?
Pour comprendre les échelles du vivant, retiens ces ordres de grandeur :
| Objet | Taille approximative |
|---|---|
| Atome | $0{,}1\ \mathrm{nm}$ |
| Ribosome | $25\ \mathrm{nm}$ |
| Virus | $100\ \mathrm{nm}$ |
| Bactérie | $1$ à $2\ \mu\mathrm{m}$ |
| Cellule animale ou végétale | $10$ à $100\ \mu\mathrm{m}$ |
| Œuf de grenouille | $1\ \mathrm{mm}$ |
Rappel : $1\ \mathrm{mm} = 1\,000\ \mu\mathrm{m}$ et $1\ \mu\mathrm{m} = 1\,000\ \mathrm{nm}$.
Le schéma présente une échelle de tailles avec les limites de résolution de l'œil humain, du microscope optique (MO) et du microscope électronique à transmission (MET).…
Le schéma présente une échelle de tailles avec les limites de résolution de l'œil humain, du microscope optique (MO) et du microscope électronique à transmission (MET). Indiquer quel instrument serait nécessaire pour observer en détail : a) un virus de la grippe ; b) une bactérie ; c) un ribosome ; d) une cellule de la peau. Justifier chaque choix à partir du schéma.
Le pouvoir de résolution
Quand on agrandit une photo de mauvaise qualité sur un écran, les détails n'apparaissent pas. Qu'est-ce qui fixe vraiment le détail visible ?
Ordres de grandeur : œil humain $\approx 0{,}1\ \mathrm{mm}$ ; microscope optique $\approx 200\ \mathrm{nm}$ ; MET jusqu'à $\approx 0{,}2\ \mathrm{nm}$. Retiens surtout que le microscope électronique montre des détails que le microscope optique ne montre pas.
Grâce au MET, on peut interpréter des images d'organites (mitochondries, ribosomes) et de virus, invisibles au MO. Mais la microscopie électronique a des limites pratiques : appareil très coûteux et volumineux, préparation longue et délicate, échantillon mort.
Le microscope électronique révèle des organites et des virus que le microscope optique ne peut pas montrer. Expliquer à quelle propriété du faisceau d'électrons est dû…
Le microscope électronique révèle des organites et des virus que le microscope optique ne peut pas montrer. Expliquer à quelle propriété du faisceau d'électrons est dû son pouvoir de résolution plus élevé et indiquer deux limites pratiques de la microscopie électronique par rapport à la microscopie optique.
Un laboratoire biomédical doit observer en détail les altérations ultrastructurales des crêtes mitochondriales et des ribosomes liés au RER dans des biopsies de patients…
Un laboratoire biomédical doit observer en détail les altérations ultrastructurales des crêtes mitochondriales et des ribosomes liés au RER dans des biopsies de patients atteints d'une myopathie. Un technicien propose de fixer le tissu au formaldéhyde, de le colorer au bleu de méthylène et de l'observer au microscope optique avec un objectif à immersion 100× et de la lumière visible (longueur d'onde moyenne de 550 nm).
Justifier quantitativement, à l'aide du concept de limite de résolution et de l'équation d'Abbe, pourquoi cette proposition ne permet pas de résoudre les crêtes et les ribosomes (20-30 nm). Concevoir ensuite le protocole technique approprié : préciser quelle modalité exacte de microscopie doit être utilisée et justifier pourquoi il est indispensable de couper l'échantillon en coupes ultrafines (inférieures à 100 nm) et de le contraster avec des sels de métaux lourds (comme l'osmium ou l'uranium) plutôt qu'avec des colorants organiques.
Préparer un échantillon
Une cellule vivante est presque transparente : sans préparation, on ne voit presque rien. Comment la rendre observable ?
Colorer un échantillon sert à augmenter le contraste (les structures presque transparentes ressortent) et à repérer des structures précises (noyau, amidon…).
En microscopie électronique, la préparation est beaucoup plus lourde : fixation, déshydratation, inclusion dans une résine, coupes ultrafines, puis contraste avec des métaux lourds.
Trier des objets selon leur taille : la filtration
Un filtre à membrane est percé de pores de diamètre connu : il retient les objets plus gros que les pores et laisse passer les plus petits.
La plupart des échantillons biologiques sont colorés avant d'être observés au microscope optique. Expliquer deux raisons de colorer un échantillon et nommer un colorant…
La plupart des échantillons biologiques sont colorés avant d'être observés au microscope optique. Expliquer deux raisons de colorer un échantillon et nommer un colorant couramment utilisé au laboratoire du lycée.
Vous disposez d'une suspension aqueuse contenant un mélange inconnu de quatre composants biologiques : des particules du virus de la grippe (~100 nm), des cellules…
Vous disposez d'une suspension aqueuse contenant un mélange inconnu de quatre composants biologiques : des particules du virus de la grippe (~100 nm), des cellules d'Escherichia coli (~2 µm), des érythrocytes humains (~7,5 µm) et des ribosomes purifiés (~25 nm). Au laboratoire, vous disposez de filtres à membrane de pores de 0,22 µm et de 5 µm, d'un microscope optique (limite de résolution : 0,2 µm) et d'un microscope électronique à transmission.
Concevoir une procédure analytique en deux phases (séparation par filtration successive et inspection microscopique) permettant de séparer et d'identifier sans ambiguïté chacun des quatre composants. Justifier dans quelle fraction (retenu ou filtrat) se trouvera chaque composant à chaque étape et déterminer quel instrument microscopique précis est indispensable pour confirmer la présence et la morphologie de chacun, en déduisant pourquoi le microscope optique est inutile pour deux d'entre eux.
Vers le début : la paramécie restait floue parce que l'on n'avait ni coloration ni résolution suffisante ; avec le bon instrument et une préparation adaptée, ses structures deviennent visibles.