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La génétique moléculaire · La génétique mendélienne

Analyse d'arbres généalogiques

Tu as intérêt à maîtriser : Dominance et récessivité (classe de 3e (collège, cycle 4 — année du brevet))

Le frère de Chloé est atteint de mucoviscidose, une maladie génétique grave. Ses parents et elle sont en bonne santé. Chloé se demande si elle peut, sans le savoir, être porteuse de l'allèle responsable, et quel risque elle aurait de transmettre la maladie à un enfant. Pour répondre, il faut savoir lire un arbre généalogique et en tirer des conclusions sur les génotypes. C'est exactement la démarche du conseil génétique.

Lire un arbre généalogique

Un arbre généalogique résume, sur plusieurs générations, la transmission d'un caractère (souvent une maladie) dans une famille. Avant de raisonner sur les allèles, il faut lire correctement les symboles.

Symboles d'un arbre généalogique : homme et femme, sains et atteints, trait d'union du couple, trait de descendance, trait de fratrie et générations I et II homme sain homme atteint femme saine femme atteinte I II union (couple) descendance (fratrie)

Pour déduire un mode de transmission, il faut au minimum : le sexe de chaque individu, son phénotype (atteint ou sain), les liens de parenté (couples et enfants) et un nombre suffisant de générations et d'individus. Un arbre trop petit laisse souvent plusieurs hypothèses possibles.

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Expliquer la signification des symboles de base d'un arbre généalogique : carrés et cercles, symboles pleins et vides, trait horizontal reliant deux individus et trait…

Expliquer la signification des symboles de base d'un arbre généalogique : carrés et cercles, symboles pleins et vides, trait horizontal reliant deux individus et trait vertical qui en descend.

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Quelles informations minimales un arbre généalogique doit-il comporter pour pouvoir déduire le mode de transmission d'un caractère ? Indiquer au moins trois données…

Quelles informations minimales un arbre généalogique doit-il comporter pour pouvoir déduire le mode de transmission d'un caractère ? Indiquer au moins trois données indispensables et justifier leur utilité.

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Transmission autosomique : dominante ou récessive

Deux familles sont étudiées. Dans la famille A, une forme de polydactylie (doigts surnuméraires) apparaît chez les grands-parents, les parents et les enfants, sans interruption. Dans la famille B, deux parents à la pigmentation normale ont un enfant albinos. Pourquoi certains caractères apparaissent-ils à chaque génération, alors que d'autres réapparaissent après avoir « disparu » ?

Dans les deux cas, le gène est sur un autosome : hommes et femmes ont la même probabilité d'être atteints.

Arbre généalogique de trois générations en transmission autosomique dominante : des individus atteints à chaque génération, chacun ayant un parent atteint autosomique dominant : aucun saut de génération I II III homme femme atteint(e) Arbre généalogique en transmission autosomique récessive : deux parents sains porteurs ont trois enfants, dont une fille atteinte parents sains porteurs (A//a) I II fille atteinte (a//a) le point noir marque un porteur sain
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Décrire deux caractéristiques d'un arbre généalogique qui font soupçonner qu'une maladie se transmet selon un mode autosomique dominant, et justifier chacune d'elles.

Décrire deux caractéristiques d'un arbre généalogique qui font soupçonner qu'une maladie se transmet selon un mode autosomique dominant, et justifier chacune d'elles.

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Décrire deux caractéristiques d'un arbre généalogique qui font soupçonner qu'une maladie se transmet selon un mode autosomique récessif, et expliquer pourquoi, dans ces arbres, on trouve fréquemment des parents sains ayant des enfants atteints.

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La phénylcétonurie est une maladie autosomique récessive. Un couple de cousins germains, tous deux sains mais avec un antécédent familial de la maladie, a un enfant…

La phénylcétonurie est une maladie autosomique récessive. Un couple de cousins germains, tous deux sains mais avec un antécédent familial de la maladie, a un enfant atteint. a) Indiquer les génotypes des parents. b) Calculer la probabilité que leur prochain enfant soit aussi atteint. c) Expliquer pourquoi la consanguinité augmente la probabilité d'apparition de maladies récessives dans la descendance.

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Démarche : identifier le mode de transmission par exclusion

Un arbre ne « prouve » presque jamais un mode de transmission. On procède par exclusion : on cherche, dans l'arbre, les situations qui rendent une hypothèse impossible. Il reste alors l'hypothèse (ou les hypothèses) la plus probable.

Deux motifs d'exclusion : parents sains avec enfant atteint (allèle récessif) et parents atteints avec enfant sain (allèle dominant) parents sains, enfant atteint ⇒ allèle récessif parents atteints, enfant sain ⇒ allèle dominant

Ensuite, on teste la localisation du gène : autosome ou chromosome X ? On cherche un contre-exemple à l'hypothèse « lié à X » (par exemple une fille atteinte dont le père est sain, pour un allèle récessif).

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Un couple dont les deux membres sont atteints de la même maladie héréditaire a trois enfants : deux atteints et un sain. Justifier si la maladie peut être due à un…

Un couple dont les deux membres sont atteints de la même maladie héréditaire a trois enfants : deux atteints et un sain. Justifier si la maladie peut être due à un allèle récessif ou à un allèle dominant et indiquer le génotype le plus probable des parents.

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Deux parents sains ont une fille atteinte d'une maladie héréditaire. Justifier pourquoi la maladie doit être due à un allèle récessif et pourquoi, de plus, il ne peut…

Deux parents sains ont une fille atteinte d'une maladie héréditaire. Justifier pourquoi la maladie doit être due à un allèle récessif et pourquoi, de plus, il ne peut pas s'agir d'une hérédité liée au chromosome X.

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L'arbre généalogique du schéma montre la transmission d'une maladie héréditaire sur trois générations ; les symboles pleins correspondent aux individus atteints. a)…

L'arbre généalogique du schéma montre la transmission d'une maladie héréditaire sur trois générations ; les symboles pleins correspondent aux individus atteints. a) Déduire le mode de transmission le plus probable de la maladie et le justifier. b) Indiquer le génotype des individus I-1 et I-2. c) Indiquer les génotypes possibles de l'individu marqué d'un ? et la probabilité qu'elle soit porteuse, en justifiant la réponse.

I II III Sain(e) Atteint(e) ? À étudier I-1 I-2 II-1 II-2 II-4 II-3 III-1 III-2 ?
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Dans une famille, une même maladie apparaît chez le grand-père, chez l'une de ses filles et chez deux des trois enfants de celle-ci, touchant indifféremment hommes et…

Dans une famille, une même maladie apparaît chez le grand-père, chez l'une de ses filles et chez deux des trois enfants de celle-ci, touchant indifféremment hommes et femmes ; en revanche, aucun enfant des personnes saines de la famille n'est atteint. Déduire le mode de transmission le plus probable et attribuer les génotypes les plus probables aux trois générations.

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Transmission récessive liée au chromosome X

Un gène porté par le chromosome X est présent en deux exemplaires chez la femme ($XX$) mais en un seul chez l'homme ($XY$) : l'homme est hémizygote. Une femme est atteinte seulement si elle a reçu l'allèle récessif sur ses deux X. Un homme est atteint dès qu'il a l'allèle sur son unique X. C'est le cas du daltonisme et de l'hémophilie.

Arbre généalogique de trois générations en transmission récessive liée à X : un grand-père atteint, une fille conductrice et un petit-fils atteint récessif lié à X : transmission « en croix » fille conductrice petit-fils atteint
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Indiquer deux caractéristiques d'un arbre généalogique qui orientent vers une hérédité récessive liée au chromosome X, et expliquer pourquoi, dans ce mode de…

Indiquer deux caractéristiques d'un arbre généalogique qui orientent vers une hérédité récessive liée au chromosome X, et expliquer pourquoi, dans ce mode de transmission, la plupart des personnes atteintes sont des hommes.

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Dans une maladie récessive liée au chromosome X, un homme atteint a des fils et des filles avec une femme saine non porteuse. Expliquer à quels descendants il…

Dans une maladie récessive liée au chromosome X, un homme atteint a des fils et des filles avec une femme saine non porteuse. Expliquer à quels descendants il transmettra avec certitude son chromosome X portant l'allèle muté et quelle conséquence cela aura sur l'aspect de l'arbre généalogique.

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Une femme à la vision normale dont le père était daltonien est mariée à un homme à la vision normale. Le couple a quatre enfants : une fille saine, une fille porteuse,…

Une femme à la vision normale dont le père était daltonien est mariée à un homme à la vision normale. Le couple a quatre enfants : une fille saine, une fille porteuse, un fils sain et un fils daltonien. a) Attribuer des génotypes aux parents et à chacun des enfants. b) Expliquer quelle caractéristique de cette famille est typique de l'hérédité liée au chromosome X.

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On étudie les antécédents cliniques d'une anomalie de la coagulation sanguine dans une famille sur trois générations : À la génération I, un homme atteint (I-1) et une…

On étudie les antécédents cliniques d'une anomalie de la coagulation sanguine dans une famille sur trois générations :

  • À la génération I, un homme atteint (I-1) et une femme saine sans antécédents (I-2) ont deux enfants : une fille saine (II-2) et un fils sain (II-3).

  • La femme II-2 a des enfants avec un homme sain (II-1) : son premier fils (III-1) est atteint de l'anomalie, son deuxième fils (III-2) est sain et sa troisième enfant (III-3) est une fille saine.

  • L'homme II-3 a deux filles saines avec une femme saine sans antécédents familiaux.

  1. a) Dessiner l'arbre généalogique complet en utilisant les symboles standard internationaux et indiquer le génotype le plus probable de chaque individu.
  2. b) Argumenter en détail pourquoi le mode de transmission correspond à une hérédité récessive liée au chromosome X, en justifiant pourquoi il ne peut s'agir ni d'une hérédité liée au chromosome Y ni d'une hérédité autosomique dominante.
  3. c) Expliquer le concept d'« hérédité croisée » (criss-cross inheritance) en l'appliquant à cet arbre généalogique, en indiquant le trajet de transmission précis de l'allèle muté de la génération I jusqu'à l'individu III-1.
  4. d) Si la femme III-3 a des enfants avec un homme sain, calculer la probabilité que son premier enfant (garçon ou fille) soit atteint de la maladie et la probabilité qu'ils aient une fille porteuse.
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Transmission dominante liée au chromosome X

Avec un allèle dominant porté par le $X$ ($X^D$), un seul exemplaire suffit à produire le phénotype. Les prévisions sont alors presque « inversées » par rapport au cas récessif.

Deux croisements en transmission dominante liée à X : père atteint et mère saine (toutes les filles atteintes, aucun fils), puis mère hétérozygote et père sain (la moitié des enfants atteints dans chaque sexe) Croisement 1 Père XᴰY Mère XᵈXᵈ XᴰXᵈ XᴰXᵈ XᵈY XᵈY → toutes les filles atteintes, aucun fils Croisement 2 Père XᵈY Mère XᴰXᵈ XᴰXᵈ XᵈXᵈ XᴰY XᵈY → la moitié des enfants atteints dans chaque sexe Femme Homme Atteint Non atteint
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Expliquer quelle caractéristique d'un arbre généalogique permet de distinguer une maladie dominante liée au chromosome X d'une maladie autosomique dominante, en prenant…

Expliquer quelle caractéristique d'un arbre généalogique permet de distinguer une maladie dominante liée au chromosome X d'une maladie autosomique dominante, en prenant comme référence ce qui se passe pour les fils et les filles des hommes atteints dans chaque cas.

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Le rachitisme hypophosphatémique vitamino-D-résistant est une maladie dominante liée au chromosome X. Un homme atteint et une femme saine ont trois filles et deux…

Le rachitisme hypophosphatémique vitamino-D-résistant est une maladie dominante liée au chromosome X. Un homme atteint et une femme saine ont trois filles et deux garçons : toutes les filles sont atteintes et aucun garçon ne l'est. a) Expliquer pourquoi ce résultat est celui attendu pour ce mode de transmission. b) Attribuer les génotypes des parents et des enfants. c) Si l'une des filles atteintes a des enfants avec un homme sain, indiquer quelle proportion de ses fils et filles on peut s'attendre à voir atteints, en justifiant.

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Comparer les modes de transmission

Pour conclure sur un arbre, confronte-le systématiquement aux quatre grands modes. Ce tableau résume les critères qui permettent d'exclure des hypothèses.

Mode Génération Sexes atteints Père atteint → enfants Indice décisif
Autosomique dominant toutes, sans saut égaux environ la moitié des fils et des filles tout atteint a un parent atteint
Autosomique récessif peut sauter égaux rarement atteints (sauf union avec porteur) parents sains, enfant atteint
Récessif lié à X peut sauter surtout des hommes filles conductrices, fils non atteints jamais de père à fils
Dominant lié à X toutes, sans saut un peu plus de femmes toutes les filles atteintes, aucun fils jamais de père à fils, filles toutes atteintes
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Dans l'arbre généalogique d'une famille, on observe qu'une maladie est transmise par toutes les femmes atteintes à tous leurs fils et filles, alors qu'aucun homme…

Dans l'arbre généalogique d'une famille, on observe qu'une maladie est transmise par toutes les femmes atteintes à tous leurs fils et filles, alors qu'aucun homme atteint ne la transmet à aucun de ses descendants. Déduire quel type d'hérédité présente cette maladie et le justifier à partir de la localisation de son information génétique et de son mode de transmission.

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On étudie trois arbres généalogiques différents. Dans l'arbre A, tous les enfants des femmes atteintes présentent la maladie et aucun enfant des hommes atteints ne la…

On étudie trois arbres généalogiques différents. Dans l'arbre A, tous les enfants des femmes atteintes présentent la maladie et aucun enfant des hommes atteints ne la présente. Dans l'arbre B, la maladie apparaît à toutes les générations et touche indifféremment hommes et femmes, et toute personne atteinte a au moins un parent atteint. Dans l'arbre C, la maladie saute des générations, touche presque toujours des garçons et ne se transmet jamais de père à fils. a) Attribuer à chaque arbre le mode de transmission le plus probable. b) Justifier chaque attribution à partir des caractéristiques décrites. c) Indiquer dans lequel des trois cas les femmes peuvent être des transmettrices saines de la maladie.

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Dans l'arbre généalogique d'une maladie rare, on observe ce qui suit : à la génération I, un homme atteint et une femme saine ont, à la génération II, une fille atteinte…

Dans l'arbre généalogique d'une maladie rare, on observe ce qui suit : à la génération I, un homme atteint et une femme saine ont, à la génération II, une fille atteinte et un fils sain ; la fille atteinte a avec un homme sain, à la génération III, un fils atteint et une fille saine. a) Déterminer si l'arbre généalogique est compatible avec une transmission autosomique dominante. b) Déterminer s'il est compatible avec une transmission dominante liée au chromosome X. c) Déterminer s'il est compatible avec une transmission autosomique récessive. d) Conclure sur le ou les modes de transmission les plus parcimonieux pour une maladie rare et justifier.

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Calculer la probabilité d'être porteur et un risque

Revenons à Chloé. Ses parents sont sains et son frère est atteint : la maladie est autosomique récessive, donc ses parents sont tous deux $A//a$. Chloé est saine. Quelle est la probabilité qu'elle soit porteuse ?

Couple A//a × A//a et quatre génotypes possibles pour un enfant : A//A, A//a, A//a, a//a. En excluant l'enfant atteint a//a, deux des trois cas sains sur quatre possibilités sont porteurs, soit 2/3 porteur sain (A//a) atteint (a//a) A//a A//a A//A A//a A//a a//a atteint (exclu) sains : A//A, A//a, A//a P(porteur parmi les sains) = 2/3

Vers le principe de calcul. On multiplie les probabilités des événements successifs et indépendants :

  • la probabilité que les parents soient porteurs ;

  • la probabilité que chaque parent transmette l'allèle récessif (chacun $\frac{1}{2}$, s'il est $A//a$) ;

  • on additionne les cas qui mènent au même résultat.

Deux caractères indépendants. Si deux gènes ne sont pas portés par le même chromosome (par exemple un autosome et le $X$), les probabilités de chaque caractère se multiplient. Attention au sexe de l'enfant : pour un caractère lié à X, la probabilité dépend du sexe, qui intervient comme un événement de probabilité $\frac{1}{2}$.

Retour au début : Chloé a une probabilité de $\frac{2}{3}$, soit environ 67 %, d'être porteuse. Ce n'est pas $\frac{1}{2}$ (cas d'un enfant non connu) ni $\frac{1}{4}$ : on a utilisé l'information « elle est saine ».

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Pour une maladie autosomique récessive, une femme saine a un frère atteint ; ses parents sont tous deux sains. La femme épouse un homme sain dont le père était atteint…

Pour une maladie autosomique récessive, une femme saine a un frère atteint ; ses parents sont tous deux sains. La femme épouse un homme sain dont le père était atteint et dont la mère était homozygote normale. a) Calculer la probabilité que la femme soit porteuse. b) Indiquer le génotype du mari. c) Calculer la probabilité que le premier enfant du couple soit atteint de la maladie.

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Un couple sain a quatre enfants : deux garçons sains, un garçon atteint d'une maladie héréditaire et une fille saine. Des années plus tard, la fille saine a, avec un…

Un couple sain a quatre enfants : deux garçons sains, un garçon atteint d'une maladie héréditaire et une fille saine. Des années plus tard, la fille saine a, avec un homme sain, un fils atteint de la même maladie. a) Justifier si la maladie correspond mieux à un mode autosomique récessif ou à un mode récessif lié au chromosome X. b) Attribuer les génotypes du premier couple et de la fille. c) Indiquer quelle probabilité la fille avait a priori d'être porteuse.

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Dans une famille, on observe deux caractères indépendants : la surdité héréditaire, autosomique récessive, et le daltonisme, récessif lié au chromosome X. Un homme sain…

Dans une famille, on observe deux caractères indépendants : la surdité héréditaire, autosomique récessive, et le daltonisme, récessif lié au chromosome X. Un homme sain et non daltonien, dont le père était sourd, a des enfants avec une femme saine porteuse de l'allèle du daltonisme, dont la mère était sourde. a) Indiquer les génotypes du couple. b) Calculer la probabilité qu'ils aient un fils sourd et daltonien. c) Calculer la probabilité qu'ils aient une fille saine pour les deux caractères. d) Justifier si une fille de ce couple pourrait être daltonienne.

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Conseil génétique et cas complexes

Du phénotype au génotype. L'arbre généalogique ne permet souvent que d'estimer des probabilités. Aujourd'hui, le séquençage de l'ADN et les bases de données permettent de lire directement le génotype. Pour la mucoviscidose, par exemple, on connaît un grand nombre d'allèles mutés du même gène. Le séquençage permet de chercher ces allèles chez les parents et de réaliser des analyses prédictives. Ainsi, une personne dont un frère est atteint peut savoir si elle est réellement porteuse, au lieu de rester sur la probabilité $\frac{2}{3}$.

Trios père, mère, enfant. En comparant les séquences de l'enfant et de ses deux parents, on repère des mutations nouvelles (de novo) : un allèle présent chez l'enfant, mais absent chez ses deux parents. Dans ce cas, un enfant atteint de parents sains ne signifie pas forcément que les parents sont porteurs.

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La maladie de Huntington est due à un allèle autosomique dominant à manifestation tardive, qui apparaît généralement à partir de 40-50 ans. Le père d'une femme de 30…

La maladie de Huntington est due à un allèle autosomique dominant à manifestation tardive, qui apparaît généralement à partir de 40-50 ans. Le père d'une femme de 30 ans, actuellement saine, a développé la maladie à 50 ans. a) Indiquer la probabilité que la femme ait hérité de l'allèle. b) Calculer la probabilité qu'un de ses enfants en hérite. c) Expliquer pourquoi les maladies dominantes d'apparition tardive posent un problème particulier dans l'analyse des arbres généalogiques et dans le conseil génétique.

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Pour une maladie autosomique récessive, la fréquence des porteurs sains dans la population générale est de 1 sur 25. Un homme sain a une sœur atteinte et envisage…

Pour une maladie autosomique récessive, la fréquence des porteurs sains dans la population générale est de 1 sur 25. Un homme sain a une sœur atteinte et envisage d'avoir des enfants avec une femme sans antécédents familiaux de la maladie. a) Calculer la probabilité que l'homme soit porteur. b) Calculer la probabilité que le couple ait un enfant atteint. c) Justifier comment le risque changerait si le couple était formé de cousins germains ayant un grand-parent commun atteint, sans faire le calcul numérique.

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Un couple se rend à une consultation de conseil génétique. Le grand-père paternel de l'homme a été atteint d'une maladie autosomique dominante à pénétrance complète,…

Un couple se rend à une consultation de conseil génétique. Le grand-père paternel de l'homme a été atteint d'une maladie autosomique dominante à pénétrance complète, mais le père de l'homme, âgé de 60 ans, est sain. Du côté de la femme, sa mère est porteuse connue d'une maladie récessive liée au chromosome X. a) Indiquer, en justifiant, quelle est la probabilité que l'homme transmette la maladie dominante. b) Calculer la probabilité que la femme soit porteuse de la maladie liée au chromosome X. c) Calculer la probabilité que le premier fils du couple soit atteint de cette maladie. d) Résumer en quoi consiste le conseil génétique et quelles décisions il peut aider à prendre.

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L'essentiel

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